Dans cet article, nous offrons un regard sur le niveau institutionnel de l'innovation agro-écologique face aux problèmes de pollution par les pesticides en Guadeloupe. Des entretiens menés auprès des gestionnaires guadeloupéens de l'eau et de l'agriculture ont permis de décrire le processus d'innovation, les déterminants institutionnels de l'innovation technique et l'impact de l'innovation institutionnelle sur l'innovation technique mise en oeuvre par les agriculteurs. Il apparaît que l'innovation institutionnelle face au problème de pollution est aussi riche que variée (lieux de dialogue ouverts, les réseaux renforcés, etc.). L'innovation technique est cependant conditionnée par les incitations que reçoivent les agriculteurs, l'impact de ces innovations techniques sur leur situation économique et l'adaptation des outils d'information et de formation à leurs besoins (hétérogènes). Pour influencer le changement dans les systèmes de production, il est nécessaire d'apporter, en plus de l'objet technique, le "package institutionnel" correspondant et de l'adapter à la diversité des territoires. L'innovation institutionnelle peut donc conditionner l'innovation technique à condition qu'elle ne délaisse pas le processus de diffusion.