Les cyanobactéries aussi appelées algues bleues ont la capacité de synthétiser des cyanotoxines. Leurs proliférations peuvent affecter la sécurité sanitaire des plans d'eau, notamment quand des activités nautiques y sont implantées. C'est le cas sur les quatre grands lacs aquitains surveillés dans le cadre du programme phytoplancton-lacs-aquitains. Ce programme a pour but d'approfondir les connaissances des communautés de phytoplancton présentes. Un volet de ce programme comprend le développement d'une technique analytique pour le dosage des différentes cyanotoxines couplant une séparation chromatographique à une détection par spectrométrie de masse en tandem. Le test ELISA actuellement utilisé, est une méthode non séparative qui ne donne accès qu'à la concentration totale dite en équivalent MC-LR car ce test dose le fragment ADDA que toutes les microcystines et nodularines possèdent. La chromatographie a l'avantage de fournir les concentrations de chaque variant de toxine et permet de savoir lesquels sont les plus présents dans les lacs étudiés. Le dosage SPE-HPLC-ESI-MS/MS a été optimisé puis validé en se basant sur la norme AFNOR : Protocole d'évaluation initiale des performances d'une méthode dans un laboratoire. Les résultats de cette validation montrent que le domaine d'étalonnage est validé entre 5 et 100 µg.L-1 en linéaire et en quadratique, que les LQ, plus basses qu'en ELISA, sont d'environ 24.4 ng.L-1 et que la méthode est spécifique et avec des rendements ne montrant pas d'effets matriciels significatifs pour chaque molécule. Les quantifications de ces molécules et leurs occurrences sur les plans d'eau aquitains permettront d'en estimer les risques sanitaires.